Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpped1Q8BFS6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cpped1Q8BFS6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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