Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ChfrQ810L3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms