Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed4Q80WQ9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Zbed4Q80WQ9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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