Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Avl9Q80U56 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Avl9Q80U56 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Avl9Q80U56 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Avl9Q80U56 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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