Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms