Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfsf18Q7TS55 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfsf18Q7TS55 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms