Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms