Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv1Q704Y3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpv1Q704Y3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms