Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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