Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Atp8b3Q6UQ17 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms