Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx13Q6PHS6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx13Q6PHS6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms