Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CtifQ6PEE2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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