Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zbtb40Q6PCS8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zbtb40Q6PCS8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms