Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp49Q6P9L4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp49Q6P9L4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp49Q6P9L4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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