Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg9bQ6EBV9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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