Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smarca2Q6DIC0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smarca2Q6DIC0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smarca2Q6DIC0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms