Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Msl2Q69ZF8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms