Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg9aQ68FE2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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