Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irf4Q64287 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irf4Q64287 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irf4Q64287 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Irf4Q64287 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irf4Q64287 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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