Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifit1Q64282 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms