Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim24Q64127 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms