Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tfe3Q64092 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms