Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Polr2kQ63871 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Polr2kQ63871 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms