Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift52Q62559 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ift52Q62559 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms