Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm5dQ62240 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm5dQ62240 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms