Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rbm38Q62176 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rbm38Q62176 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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