Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prkd1Q62101 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms