Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Itga6Q61739 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms