Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hes3Q61657 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hes3Q61657 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms