Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp4Q60972 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms