Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Neurod1Q60867 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms