Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot7Q60809 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms