Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samhd1Q60710 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms