Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc5a6Q5U4D8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc5a6Q5U4D8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc5a6Q5U4D8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Slc5a6Q5U4D8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms