Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Utp18Q5SSI6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms