Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88aQ5SNZ0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88aQ5SNZ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms