Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf3Q5HZG4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms