Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam208bQ5DTT3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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