Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Xirp2Q4U4S6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms