Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syne3Q4FZC9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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