Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2al1nQ497L1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms