Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b4Q3V0X2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b4Q3V0X2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b4Q3V0X2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cldn34b4Q3V0X2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34b4Q3V0X2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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