Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim9Q3V0X1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim9Q3V0X1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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