Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6899Q3USS0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6899Q3USS0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms