Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
E130208F15RikQ3UPV3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms