Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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