Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nlrc4Q3UP24 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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