Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp19Q3UJD6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms