Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm648Q3UJ22 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm648Q3UJ22 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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