Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nkx6-3Q3UHX8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nkx6-3Q3UHX8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nkx6-3Q3UHX8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nkx6-3Q3UHX8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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